Le 21 mars 1098, Robert de Molesmes, accompagné de quelques disciples, s'installe au coeur d'une forêt marécageuse située non loin de Dijon et de Saint Jean de Losne. 
C'est au beau milieu des "cistels" (des roseaux) qu'il érigera "le nouveau monastère", selon la loi très stricte de Saint Benoit. 
En 1112, une trentaine de jeunes gens, conduits par Bernard de Fontaine, rejoint Etienne Harding à Citeaux. 
Saint Bernard développera de façon décisive l'ordre cistercien. 

Chassés de leur monastère lors de la Révolution française, les moines trappistes de Citeaux le réintégrèrent le 2 octobre 1898. 

Durant près de 9 siècles, l'influence exercée par l'abbaye sur le monde occidental fut immense. 
Il en résulte de prestigieux souvenirs dans les domaines de l'art sacré, des scinces et techniques, de l'architecture et de l'écri : l'abbaye de Fontenay, inscrite au patrimoine mondial de l'UNESCO, celle de Pontigny, la communauté trappiste de l'abbaye de Soligny-la-trappe en Basse Normandie, les superbes abbayes du Sud de la France telles que Fontfroide, Sénanque, le Thoronet ou Lérins dans les Alpes maritime,  le vignoble du clos de Vougeot en Côte d'Or, créés par les moines cisterciens, les manucrits des toutes premières heures du monastére, conservés à la Bibliothèque municipale de Dijon. 

Si Citeaux a éclairé le monde spirituel et artistique, son influence s'est étendue jusqu'aux secteurs de l'économie, de l'agriculture, des techniques du fer, de l'hydraulique.. 
Ce travail de recherche, de par sa rigueur et sa constance, a eu d'importantes répercussions sur la vie quotidienne. 
 L'histoire de l'abbaye de Citeaux est liée à l'histoire de Saint Jean de Losne par le grenier à sel et par un organiste.